Քրիստինե Գյոնջյանը մեծ ներդրում է ունեցել Հայաստանի պետական տնտեսագիտական համալսարանի «Տեղեկատվական տեխնոլոգիաները բիզնեսում» մագիստրոսական ծրագրի ստեղծման և իրականացման գործում և այժմ մագիստրոսական ծրագրի ղեկավարն է, ինչպես նաև դասավանդում է «Ստարտափների կառավարում և նորարարություն» առարկան նույն համալսարանում։
2016-2017 թվականներին եղել է «Արփինետ» ՍՊԸ-ի Բիզնեսի զարգացման և մարքեթինգի բաժնի ղեկավարը: 2016-2017 թվականներին ղեկավարել է «Հայ Միասնության Խաչի Նորարար Էթնիկ Տարածաշրջանային Կենտրոնը»՝ մեծ ներդրում ունենալով կենտրոնի կայացման գործում։ 2008-2016 թվականներին աշխատել է Microsoft ընկերությունում՝ որպես կրթական ծրագրերի ղեկավար՝ նպաստելով կրթական գործընթացներում տեխնոլոգիաների ներդրմանը։ Նա պարբերաբար աշխատել է Եվրոպական միության մի շարք նախագծերում՝ հանդես գալով որպես էլեկտրոնային ուսուցման միջազգային փորձագետ:
Նա ունի ավելի քան 20 տարվա դասավանդման փորձ բուհերում և որպես դասախոսների և պետական ծառայողների վերապատրաստող: Դասավանդել է Հայկական պետական մանկավարժական համալսարանում, Հայաստանի ազգային պոլիտեխնիկական համալսարանում, Գ.Վ. Պլեխանով, Եվրոպական տարածաշրջանային ակադեմիա, Եվրասիա միջազգային համալսարան, Ինտերլինգվա համալսարան, Երևանի էկոնոմիկայի և իրավունքի համալսարանում։