Մանուշ Միրզոյանը աշխատում է «Վեոլիա Ջուր» ՓԲԸ-ում որպես իրավախորհրդատու և ապահովագրական համակարգող, որտեղ նա տրամադրում է իրավաբանական խորհրդատվություն և կառավարում է բարդ ապահովագրական հարցերը: Նախքան «Վեոլիա Ջուր» ՓԲԸ-ում աշխատելը նա զբաղեցրել է կարևոր պաշտոններ Հայաստանի Հանրապետության Մարդու իրավունքների պաշտպանի գրասենյակում, այդ թվում՝ Մարդու իրավունքների պաշտպանի տեղակալի պաշտոնը։
Մանուշը ՀՀ փաստաբանական պալատի անդամ է։ Նա աշխատել է նաև ՀՀ քաղաքացիական ծառայության խորհրդի աշխատակազմի իրավաբանական վարչությունում որպես առաջատար, ապա՝ գլխավոր մասնագետ, իսկ 1999-2002 թվականներին՝ ՀՀ առևտրի և տնտեսական զարգացման նախարարության Օրենսդրության և իրավաբանական վարչությունում որպես առաջատար, ապա՝ գլխավոր մասնագետ։